Dystrybucja różnic nukleotydowych w kilku sekwencjach genu ANG. Sekwencja 2751-nukleotydowa genu gyrA jest przedstawiona w skali z użyciem izolatu od Pacjenta (zakażonego Neisseria meningitidis oporną na ciprofloksacynę) i powielonego DNA bakterii od opiekunki w Północnej Dakocie, który był uważany za zakażone wrażliwym na cyprofloksacynę N. meningitidis (Panel A), izolatem opornym na ciprofloksacynę N. meningitidis od pacjenta z Kalifornii (2008) i zamplifikowanym bakteryjnym DNA od opiekuna (panel B) oraz izolatem od Pacjent i izolat N. lactamica od uczestników badania przewozu w Północnej Dakocie-Minnesocie (gen gyrA N. lactamica składa się z 2739 nukleotydów) (panel C). Każda pionowa linia reprezentuje zmianę nukleotydów. Gwiazdka wskazuje na zmianę nukleotydu cytozyn do tyminy, która prowadzi do mutacji związanej z opornością na cyprofloksacynę (T91I). Chociaż dokładny punkt przerwania rekombinacji nie jest znany, prawdopodobnie nie występuje przed nukleotydem 1265 (oznaczonym jako delta [.]). Sekwencjonowanie izolatu od Pacjenta jest reprezentatywne dla Pacjenta 2, Pacjenta 3 i bliskiego kontaktu Pacjenta 3. Pierwsze 1265 nukleotydów genu gyrA z izolatów opornych na cyprofloksacynę w Dakocie Północnej i Minnesocie miało tylko 94% podobieństwa do tego samego regionu zamplifikowanego z płynu mózgowo-rdzeniowego pracownika opieki nad dziećmi, podczas gdy końcowe 1486 nukleotydów było identyczne, co sugeruje poziomy transfer genu ( Figura 2A). Sekwencja gyrA izolatu od pacjenta z Kalifornii również wykazała mutację T91I; jednak gen był 99,7% podobny do gyrA amplifikowanego z płynu mózgowo-rdzeniowego pracownika opieki nad dziećmi, co jest zgodne z różnicami wewnątrzgatunkowymi (figura 2B). Geny gyrA z trzech izolatów N. lactamica w badaniu przewozu w Północnej Dakocie-Minnesocie zostały zsekwencjonowane. W porównaniu z genem gyrA z izolatów N. meningitidis opornych na Dakota-Minnesota, opornych na ciprofloksacynę, gen gyrA z jednego z izolatów N. lactamica miał różnicę pojedynczego nukleotydu w pierwszych 1265 nukleotydach w pozycji kodującej mutację T91I w Izolaty N. meningitidis (99,9% podobieństwa). Następne 1441 nukleotydów miało 90% podobieństwa, co sugeruje, że szczep N. lactamica był dawcą do poziomego transferu genów (Figura 2C). Analiza filogenetyczna QRDR z 132 szczepów N. meningitidis, N. gonorrhoeae i N. lactamica wykazała grupowanie według gatunków, z wyjątkiem izolatów N. meningitidis opornych na cyprofloksacynę z Dakoty Północnej i Minnesoty, które zostały zgrupowane w skupisku N. lactamica. (szczegółowe informacje zawiera Dodatek Uzupełniający).
Dyskusja
Zgłaszamy pojawienie się N. meningitidis opornych na cyprofloksacynę w Ameryce Północnej. Ponieważ pacjenci nie mieli powiązań epidemiologicznych, a czas trwania bezobjawowego transportu meningokoków jest często ograniczony do kilku miesięcy lub mniej, 3,21 podejrzewamy, że szczep oporny na cyprofloksacynę prawdopodobnie był utrzymywany w obszarze North Dakota-Minnesota przez wielu nosicieli. Chociaż nasze badanie przewozu wskazało tylko jednego nosiciela szczepu opornego na cyprofloksacynę, to niskie rozpowszechnienie należy interpretować ostrożnie, ponieważ zjadliwe N
[hasła pokrewne: leczenie chorób genetycznych, depilacja laserowa ceny, mocz badanie ogólne cena ]
Powiązane tematy z artykułem: depilacja laserowa ceny leczenie chorób genetycznych mocz badanie ogólne cena